ATmega16芯片有如下几种通过Flash熔丝位进行选择的时钟源。时钟输入到AVR时钟发生器，再分配到相应的模块。

不同的时钟选项将在后续部分进行介绍。当CPU 自掉电模式或省电模式唤醒之后，被选择的时钟源用来为启动过程定时，保证振荡器在开始执行指令之前进入稳定状态。当CPU从复位开始工作时，还有额外的延迟时间以保证在MCU 开始正常工作之前电源达到稳定电平。这个启动时间的定时由看门狗振荡器完成。看门狗溢出时间所对应的WDT 振荡器周期数列于Table 3。看门狗振荡器的频率由工作电压决定，详见 P286“ATmega16 典型特性” 。

缺省时钟源

器件出厂时CKSEL = “0010”， SUT = “10”。这个缺省设置的时钟源是1 MHz 的内部RC振荡器，启动时间为最长。这种设置保证用户可以通过ISP 或并行编程器得到所需的时钟源。