时钟控制器功能强大而且灵活易用。其目的在于使用户在获得最好性能的同时，亦能保证消耗的功率最低。用户可独立地管理各个时钟源，并将它们分配到CPU或各个外设。主时钟和CPU时钟均带有预分频器。具有安全可靠的无故障时钟切换机制，可在程序运行中将主时钟从一个时钟源切换到另一个时钟源。抗电磁干扰时钟配置寄存器,STM8为了避免由电磁干扰造成的对应用程序误写操作或系统挂起，大多数关键的时钟配置寄存器都有一个互补寄存器与之相对应。系统将会自动检测这些关键寄存器与其互补寄存器之间是否匹配。如果不匹配，则产生一个EMS复位，从而使应用程序恢复到正常操作。详情请参见时钟寄存器描述。

(图13：STM8时钟树)